闪光宝可梦的获取方式主要依赖于野外遭遇和特定剧情触发。闪光宝可梦的出现概率极低，通常为1/4096，因此需要玩家投入大量时间进行反复刷取。闪光宝可梦的外观与普通个体存在明显差异，但属性与能力值并无区别。玩家可以通过在特定地点反复遭遇野生宝可梦来提高遇见闪光的概率，例如常磐森林的绿毛虫或4号道路的鲤鱼王。
闪光宝可梦的刷取需要玩家具备一定的耐心和技巧。部分玩家会选择在游戏早期存档点附近反复重置游戏，以快速刷新遭遇的宝可梦。例如在月见山洞口或紫苑镇宝可梦塔前存档，通过软重启的方式提高效率。携带拥有同步特性的宝可梦可以略微影响遭遇宝可梦的性格，但不会改变闪光概率。闪光宝可梦的出现完全随机，无法通过任何游戏内机制直接提升概率。
部分剧情相关的宝可梦也存在闪光形态，例如超梦或御三家。这类宝可梦的闪光形态需要在遭遇前存档，并通过反复重置游戏来刷取。由于剧情宝可梦的遭遇次数有限，刷取闪光的难度较高。玩家在挑战道馆或推进主线剧情时，可以留意这些关键战斗的存档机会。部分玩家会利用多个游戏设备同时刷取，以缩短时间成本。
游戏中的隐藏机器05（HM05）闪光术并非用于获取闪光宝可梦，而是作为探索技能使用。玩家在收服10种宝可梦后，可向博士助手领取该技能机。闪光术主要用于照亮岩山隧道等黑暗区域，与闪光宝可梦无直接关联。部分玩家可能混淆两者概念，需注意区分。
联机交换是另一种获取闪光宝可梦的途径，但需确保交换对象的合法性。部分修改器生成的闪光宝可梦可能无法通过正版游戏验证，且存在损坏存档的风险。建议玩家通过正规渠道进行交换，或自行刷取以保证数据安全。游戏内并无官方活动或任务直接奖励闪光宝可梦，所有闪光个体均需通过遭遇或交换获得。
