主将和副将的兵种平衡是提升部队战斗力的核心策略之一。主副将的兵种加成差异直接影响实战表现，因此需优先选择对当前兵种加成最高的统帅担任主将，以最大化伤害输出。若主将擅长骑兵加成，副将则应搭配步兵或弓兵统帅，通过技能互补弥补单一兵种的短板。主将需达到三星以上星级才能解锁副将位，这意味着前期资源需集中培养主力武将。
主将和副将的技能效果可相互辅助，但需注意相同类型的增益或减益效果无法叠加。主将提供攻击力加成，副将则可选择防御或治疗类技能，形成攻守兼备的阵容。副将的天赋不会生效，因此主将的天赋强度尤为重要，建议优先选择天赋包含兵种专精（如骑兵、步兵、弓兵）的统帅。前期可优先培养稀有度高的橙色或紫色武将，确保基础战力达标。
由于统帅升级速度较慢，解锁副将后需在日常战斗中频繁调整阵容以积累经验。骑兵主将搭配弓兵副将时，需确保弓兵科技与骑兵同步发展，避免因兵种等级差距导致属性失衡。采集类武将（如埃及艳后、贞德）可作为副将专精资源获取，但需避免将其用于主力战斗阵容，以免浪费天赋加成。
后期战斗中，兵种克制关系对平衡策略影响显著。骑兵被步兵克制，步兵被弓兵克制，弓兵则惧怕骑兵突袭。主副将的兵种选择需根据敌方阵容动态调整。面对步兵为主的敌人时，可启用弓兵主将+骑兵副将的组合，利用射程优势压制对手。主将的觉醒技能（如源义经的多段伤害）可大幅提升输出效率，但需搭配副将的控场或治疗技能以保障生存能力。
主副将的兵种组合并非固定模板，需根据联盟战、野怪扫荡等不同场景调整。集结进攻时可选择高爆发主将（如凯撒）与辅助型副将（如孙武），而驻防时则需侧重防御天赋的步兵统帅。通过持续优化阵容和科技研究，玩家可逐步实现兵种全面均衡，在万国战场上占据主动优势。
